Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRFP10586 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRFP10586 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRFP10586 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PTPRFP10586 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRFP10586 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTPRFP10586 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTPRFP10586 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTPRFP10586 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
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PTPRFP10586 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 ZNF397-202ENST00000330501 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 RAPGEF5-202ENST00000401957 6159 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRFP10586 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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