Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 MT1B-202ENST00000562399 351 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC006557.4-201ENST00000585516 830 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 F5-202ENST00000367797 7024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ABCB1-210ENST00000543898 4524 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 KIF2B-201ENST00000268919 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CEP192-202ENST00000430049 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CCDC191-201ENST00000295878 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL450992.1-201ENST00000432386 4109 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MTRF1-202ENST00000379477 1948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 EPHA7-201ENST00000369297 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DNAJA1P6-201ENST00000437347 354 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 PRSS48-201ENST00000441586 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR7A15P-201ENST00000449848 1009 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 YAP1P2-201ENST00000455104 610 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 NR1I3-226ENST00000508740 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 AC142086.3-201ENST00000563896 802 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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TRIM35Q9UPQ4 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TBX22-202ENST00000373296 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 DDX43P1-201ENST00000510713 1763 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CDC42-201ENST00000315554 1452 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 AGPAT4-201ENST00000320285 7865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 TP63-203ENST00000354600 4668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 ZNF613-201ENST00000293471 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 OR9K2-201ENST00000305377 1122 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TRIM35Q9UPQ4 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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