Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PTCHD3P1-201ENST00000612350 537 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AL353651.1-201ENST00000415629 355 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PPARGC1AQ9UBK2 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms