Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC023866.2-201ENST00000521378 387 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP002498.1-201ENST00000530190 568 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ZNF677-211ENST00000601828 719 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 RPL5P20-201ENST00000403848 896 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP4Q9P0V3 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms