Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 TEX41-271ENST00000628213 993 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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RAB6CQ53S08 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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RAB6CQ53S08 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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RAB6CQ53S08 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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RAB6CQ53S08 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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RAB6CQ53S08 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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RAB6CQ53S08 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
RAB6CQ53S08 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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