Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC092376.1-201ENST00000569677 335 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RTL8BQ17RB0 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms