Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SUMO2P8-201ENST00000434672 286 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 BBIP1-205ENST00000436562 383 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
SIX1Q15475 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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