Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
GTF2H3Q13889 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms