Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MID1-201ENST00000317552 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AF117829.2-201ENST00000619538 361 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC078842.2-201ENST00000447529 1835 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 LINC01151-201ENST00000521608 571 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CACNA1SQ13698 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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