Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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CUL4AQ13619 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CUL4AQ13619 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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