Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LAMTOR5-AS1-248ENST00000630488 703 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 FKBP1AP4-201ENST00000631775 336 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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FOXE3Q13461 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AL160396.1-201ENST00000637433 575 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
FOXE3Q13461 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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