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| FOXE3 | Q13461 | AP000255.1-201 | ENST00000610276 | 676 nt | BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | uc_338.37-201 | ENST00000620113 | 186 nt | BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LAMTOR5-AS1-248 | ENST00000630488 | 703 nt | TSL 5 BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FKBP1AP4-201 | ENST00000631775 | 336 nt | BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | OR4D10-201 | ENST00000530162 | 2482 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | MDM4-204 | ENST00000367183 | 9098 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NFATC3-201 | ENST00000329524 | 6144 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ADAM3A-207 | ENST00000490268 | 2627 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF658B-201 | ENST00000602828 | 3408 nt | BASIC | 5.76 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NRXN1-211 | ENST00000406859 | 2553 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NT5C2-203 | ENST00000404739 | 3365 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SPATA31A1-201 | ENST00000377647 | 4256 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | JCHAIN-206 | ENST00000543780 | 1406 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PWRN1-212 | ENST00000569908 | 1435 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | FTO-206 | ENST00000471389 | 11766 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZNF610-202 | ENST00000327920 | 1855 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | USP32-214 | ENST00000592339 | 4045 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC7A6-216 | ENST00000618043 | 6124 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL449283.1-201 | ENST00000602631 | 3403 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CPXCR1-201 | ENST00000276127 | 1630 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CNPY1-204 | ENST00000636446 | 1637 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TEAD1-201 | ENST00000334310 | 3075 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | ADGRL3-206 | ENST00000507164 | 4982 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GOLGA6L22-204 | ENST00000622895 | 4178 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NOX1-201 | ENST00000217885 | 1734 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SCN2A-215 | ENST00000637266 | 8610 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CACNB2-215 | ENST00000615785 | 3707 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC5A12-201 | ENST00000280467 | 2269 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TAS2R8-201 | ENST00000240615 | 1243 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR4P4-201 | ENST00000314612 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HMGN2-201 | ENST00000361427 | 1191 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Y_RNA.517-201 | ENST00000384551 | 106 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Z86062.1-201 | ENST00000406773 | 777 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TYMSP1-201 | ENST00000407851 | 869 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC096669.1-202 | ENST00000413708 | 616 nt | TSL 2 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL731684.1-201 | ENST00000415530 | 439 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL031005.1-201 | ENST00000416959 | 723 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL021026.1-201 | ENST00000422841 | 658 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GAPDHP51-201 | ENST00000426454 | 1000 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | KCND3-AS1-202 | ENST00000427471 | 583 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ALG13-AS1-201 | ENST00000430794 | 195 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | Z99127.2-201 | ENST00000441426 | 334 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL357052.1-201 | ENST00000443504 | 381 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC069542.1-201 | ENST00000445235 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC097262.1-201 | ENST00000452559 | 548 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PEX5L-AS1-201 | ENST00000466064 | 827 nt | TSL 2 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BZW1P2-201 | ENST00000473537 | 826 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GLYCTK-AS1-203 | ENST00000493616 | 445 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AP003969.1-201 | ENST00000531846 | 400 nt | TSL 2 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC078778.2-201 | ENST00000553061 | 567 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC022898.1-202 | ENST00000560864 | 806 nt | TSL 2 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL512347.1-201 | ENST00000566420 | 503 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SCIMP-204 | ENST00000574297 | 569 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC099850.2-201 | ENST00000577660 | 557 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RN7SL657P-201 | ENST00000582431 | 293 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AL136139.1-201 | ENST00000605568 | 222 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TUG1_1.1-201 | ENST00000610654 | 145 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL359513.1-201 | ENST00000614364 | 557 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC130448.2-201 | ENST00000624082 | 374 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | JAKMIP2-AS1-202 | ENST00000627433 | 831 nt | TSL 3 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AL160396.1-201 | ENST00000637433 | 575 nt | TSL 4 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC011139.1-202 | ENST00000637744 | 563 nt | TSL 5 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LRP2-201 | ENST00000263816 | 15808 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | OR5A2-201 | ENST00000302040 | 6318 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EEF1A1P5-201 | ENST00000436459 | 1389 nt | BASIC | 5.75 | □□□□□ -1.49 | | |