Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 VCAN-208ENST00000512590 5923 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ARNTL2-207ENST00000542388 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
TCOF1Q13428 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
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TCOF1Q13428 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
TCOF1Q13428 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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