Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 LINC02318-202ENST00000556346 715 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC091180.5-201ENST00000576461 382 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AL451054.3-201ENST00000611115 776 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC006449.1-201ENST00000616263 571 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
IKZF1Q13422 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC020549.1-201ENST00000536916 1440 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 NEXN-202ENST00000334785 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 LINC02408-201ENST00000400306 1766 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 SMG1P1-202ENST00000309865 4223 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 FAM49A-201ENST00000381323 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CPSF4L-201ENST00000344935 647 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 EEF1AKMT1-202ENST00000382758 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 YBX1P8-201ENST00000421881 943 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL355516.1-201ENST00000422082 746 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL445524.1-205ENST00000425412 392 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 SATB1-AS1-202ENST00000425799 611 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 KDM4A-AS1-205ENST00000453015 647 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 PPIAP28-201ENST00000458378 485 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 LINC01182-201ENST00000503532 582 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC008638.2-201ENST00000503840 715 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 SELENOP-204ENST00000507920 786 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 GNPDA1-212ENST00000513454 980 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 RN7SL123P-201ENST00000577239 292 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
IKZF1Q13422 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms