Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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FOXF2Q12947 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXF2Q12947 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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