Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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CENPFP49454 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 TRPM7-207ENST00000560955 7218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ABLIM1-206ENST00000392952 6841 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
CENPFP49454 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 NEK1-207ENST00000511633 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 GIGYF2-204ENST00000409480 5976 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CENPFP49454 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AL513548.2-201ENST00000602994 1207 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CENPFP49454 MED12-203ENST00000374102 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CENPFP49454 KIAA1958-201ENST00000337530 11775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CENPFP49454 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
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CENPFP49454 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SHROOM4-203ENST00000460112 8919 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 FBXL20-201ENST00000264658 10388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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CENPFP49454 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 TRPM3-213ENST00000396285 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
CENPFP49454 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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