Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 FAM66C-201ENST00000372173 678 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms