Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC073896.2-202ENST00000549860 437 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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CASQ1P31415 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
CASQ1P31415 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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CASQ1P31415 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
CASQ1P31415 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
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