Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX8Q9Y5X2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX8Q9Y5X2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms