Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms