Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TNFSF13BQ9Y275 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF13BQ9Y275 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms