Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
USP18Q9UMW8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
USP18Q9UMW8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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