Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ALKQ9UM73 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALKQ9UM73 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms