Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
INO80Q9ULG1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
INO80Q9ULG1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms