Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DENND2AQ9ULE3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENND2AQ9ULE3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms