Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ZNF608Q9ULD9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ZNF608Q9ULD9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms