Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRP68Q9UHB9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SRP68Q9UHB9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms