Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ABCF2Q9UG63 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ABCF2Q9UG63 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms