Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
COPS7AQ9UBW8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
COPS7AQ9UBW8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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