Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DBF4Q9UBU7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DBF4Q9UBU7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms