Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TFIP11Q9UBB9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TFIP11Q9UBB9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms