Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC88CQ9P219 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC88CQ9P219 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms