Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDK12Q9NYV4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDK12Q9NYV4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDK12Q9NYV4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms