Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TMOD3Q9NYL9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TMOD3Q9NYL9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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