Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VPS45Q9NRW7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS45Q9NRW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms