Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNNM1Q9NRU3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNNM1Q9NRU3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms