Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DUOX2Q9NRD8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DUOX2Q9NRD8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms