Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHST12Q9NRB3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHST12Q9NRB3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms