Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SEMA4BQ9NPR2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SEMA4BQ9NPR2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms