Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SRSF8Q9BRL6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SRSF8Q9BRL6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms