Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED1Q99966 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED1Q99966 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms