Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRPK1Q96SB4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRPK1Q96SB4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms