Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMTK3Q96Q04 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMTK3Q96Q04 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms