Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC138Q96M89 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC138Q96M89 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms