Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UBE2E2Q96LR5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms