Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ABCC11Q96J66 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC11Q96J66 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms