Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZBED3Q96IU2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZBED3Q96IU2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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