Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEMA4DQ92854 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA4DQ92854 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms