Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HELBQ8NG08 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms