Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC197Q8NCU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC197Q8NCU1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms