Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKD1L3Q7Z443 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKD1L3Q7Z443 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms